اين خانه داراي بنايي دوطبقه با مساحت 820 مترمربع است و مانند ديگر خانه‌هاي بافت قديمي يزد، از مصالح بومي مانند خشت و آجر در آن استفاده شده است. علاوه بر اين، از درها و پنجره‌هاي چوبي و گچ‌بري‌ها، به عنوان تزئينات خانه استفاده شده است.
سردر ورودي بنا در سمت شمال غربي خانه قرار دارد و از طريق يک دالان به گوشه حياط راه دارد. در سه جهت حياط، اتاق‌ها و بخش‌هاي مختلف خانه ساخته شده‌اند. وسط حياط يک حوض سنگي نيز به چشم مي‌خورد.
بادگير دوطبقه خانه آقازاده بر فراز تالار اصلي است که همين امر باعث تمايز اين خانه با ديگر خانه‌هاي مناطق کويري است.
اين بادگير 18 متر ارتفاع، 18 مترمربع مساحت و 19 دريچه تنظيم جريان هوا دارد.
در اجراي بادگيرها دقت زيادي به کار رفته است، به طوريکه حتي بدون وزش باد تهويه اتاق‌ها به خوبي انجام مي‌گيرد. بادگيرهاي طبقه بالا و پايين بطور کامل با يکديگر هماهنگ هستند.
